[ ソース: tombo ]
パッケージ: tombo (1.5.1-2 など)
identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data
Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.
その他の tombo 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: cython3
- C-Extensions for Python 3
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
-
- dep: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
-
- dep: python3-h5py-serial
- general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)
-
- dep: python3-mappy
- Python3 interface minimap2
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-pkg-resources
- pkg_resources を用いたパッケージ検索およびリソースアクセス
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-tqdm
- fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool
-
- rec: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
-
- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: python3-rpy2
tombo のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.5.1-2+b2 | 421.8 kB | 1,424.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 1.5.1-2+b2 | 410.8 kB | 1,395.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 1.5.1-2+b2 | 411.9 kB | 1,387.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 1.5.1-2+b2 | 412.9 kB | 1,324.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 1.5.1-2+b2 | 423.4 kB | 1,440.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 1.5.1-2+b2 | 408.6 kB | 1,449.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 1.5.1-2+b2 | 413.9 kB | 1,408.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 1.5.1-2+b2 | 421.1 kB | 1,496.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 1.5.1-2+b2 | 408.9 kB | 1,419.0 kB | [ファイル一覧] |