パッケージ: ssw-align (1.1-15)

ssw-align に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

その他の ssw-align 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libssw0 (= 1.1-15)

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf 以外]

圧縮ライブラリ - ランタイム

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

ssw-align のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	23.6 kB	63.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	19.8 kB	82.0 kB	[ファイル一覧]
armel	23.5 kB	62.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	22.0 kB	50.0 kB	[ファイル一覧]
i386	26.2 kB	74.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	25.4 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	23.9 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	25.6 kB	55.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	26.7 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]