Paketti: ssw-align (1.1-15 ja muut)

Links for ssw-align

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti libssw:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Muut pakettiin ssw-align liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libssw0 (= 1.1-15+b1)

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ei armel, armhf]

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

Imuroi ssw-align

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.1-15+b1	22.3 kt	60.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.1-15+b1	20.2 kt	84.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.1-15+b1	24.1 kt	63.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.1-15+b1	22.5 kt	51.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.1-15+b1	26.8 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.1-15+b1	25.8 kt	84.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.1-15+b1	23.8 kt	84.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.1-15+b1	25.6 kt	56.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.1-15+b1	27.4 kt	67.0 kt	[tiedostoluettelo]