パッケージ: libjellyfish-2.0-dev (2.3.1-3 など)

libjellyfish-2.0-dev に関するリンク

Debian の資源:

jellyfish ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.genome.umd.edu]

類似のパッケージ:

count k-mers in DNA sequences (development files of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the development files (static library and header files)

タグ: ソフトウェア開発: ライブラリ, 役割: 開発ライブラリ

その他の libjellyfish-2.0-dev 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.0-12) [ia64]

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.1-2+b1) [hppa]

dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.1-3+b6) [ppc64el]

dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.1-3+b7) [hppa, ia64, ppc64el 以外]

libjellyfish-2.0-dev のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.3.1-3+b7	135.2 kB	691.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.3.1-3+b7	132.5 kB	688.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.3.1-2+b1	134.3 kB	627.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.3.0-12	150.5 kB	825.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.3.1-3+b7	139.9 kB	767.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.3.1-3+b6	140.2 kB	718.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.3.1-3+b7	270.7 kB	2,294.0 kB	[ファイル一覧]