パッケージ: libjellyfish-2.0-2 (2.3.1-3 など)

libjellyfish-2.0-2 に関するリンク

Debian の資源:

jellyfish ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.genome.umd.edu]

類似のパッケージ:

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.

タグ: 役割: 共有ライブラリ

その他の libjellyfish-2.0-2 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [hppa]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [hppa, ia64 以外]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [hppa, ia64 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

libjellyfish-2.0-2 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.3.1-3+b6	65.7 kB	205.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.3.1-3+b6	60.4 kB	221.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.3.1-2+b1	66.9 kB	208.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.3.0-12	75.2 kB	315.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.3.1-3+b6	60.6 kB	233.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.3.1-3+b6	69.5 kB	285.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.3.1-3+b6	64.5 kB	168.0 kB	[ファイル一覧]