パッケージ: hts-nim-tools (0.2.1-1 など)

hts-nim-tools に関するリンク

Debian の資源:

hts-nim-tools ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

その他の hts-nim-tools 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [riscv64 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: nim-hts-dev

wrapper for hts C library

hts-nim-tools のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	0.2.1-1	198.0 kB	864.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.2.1-1	164.6 kB	844.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.2.1-1	182.9 kB	832.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.2.1-1	182.9 kB	604.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.2.1-1	186.0 kB	843.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.2.1-1	137.8 kB	951.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.2.1-1	155.9 kB	981.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.2.1-1	158.6 kB	916.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.2.1-1+b1	158.8 kB	573.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.2.1-1	135.8 kB	944.0 kB	[ファイル一覧]