パッケージ: hts-nim-tools (0.2.1-1)

hts-nim-tools に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

その他の hts-nim-tools 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: nim-hts-dev

wrapper for hts C library

hts-nim-tools のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	198.0 kB	864.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	164.6 kB	844.0 kB	[ファイル一覧]
armel	182.9 kB	832.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	182.9 kB	604.0 kB	[ファイル一覧]
i386	186.0 kB	843.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	137.8 kB	951.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	141.6 kB	934.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	158.6 kB	916.0 kB	[ファイル一覧]