パッケージ: dnaclust (3-7 など)

dnaclust に関するリンク

Debian の資源:

dnaclust ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [dnaclust.sourceforge.net]

類似のパッケージ:

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

タグ: 生物学: Fasta/Pearson, 核酸, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: C++, 役割: role::program, works-with::biological-sequence

その他の dnaclust 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [riscv64]

C++ 用プログラムオプションライブラリ
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [riscv64 以外]

C++ 用プログラムオプションライブラリ
dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 11) [riscv64]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64, x32 以外]

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

dnaclust のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	3-7+b4	109.6 kB	735.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	3-7+b3	111.9 kB	681.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3-7+b4	105.2 kB	733.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3-7+b3	101.5 kB	646.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3-7+b3	101.2 kB	582.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	3-7+b3	107.5 kB	672.0 kB	[ファイル一覧]
i386	3-7+b3	115.6 kB	678.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	3-7+b3	124.5 kB	904.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	3-7+b3	109.9 kB	666.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3-7+b3	112.2 kB	880.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	3-7+b3	115.9 kB	861.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	3-7+b3	114.6 kB	861.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64 (非公式の移植版)	3-7+b3	103.9 kB	623.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3-7+b3	115.3 kB	701.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	3-7+b3	117.5 kB	732.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	3-7+b3	99.6 kB	3,494.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	3-7+b4	111.5 kB	650.0 kB	[ファイル一覧]