パッケージ: vt (0.57721+ds-3)

vt に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [genome.sph.umich.edu]

類似のパッケージ:

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

その他の vt 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

新しい Perl 互換正規表現ライブラリ - 8 ビットランタイムファイル
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: r-base-core

GNU R core of statistical computation and graphics system

vt のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	756.2 kB	2,565.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	624.3 kB	2,241.0 kB	[ファイル一覧]
armel	604.2 kB	2,152.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	624.4 kB	1,524.0 kB	[ファイル一覧]
i386	763.0 kB	2,776.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	576.1 kB	3,225.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	580.6 kB	2,977.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	693.5 kB	2,833.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	638.5 kB	2,533.0 kB	[ファイル一覧]