パッケージ: hinge (0.5.0-6 など)

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類似のパッケージ:

long read genome assembler based on hinging

HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.

その他の hinge 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: daligner

ロングリードヌクレオチド配列間のローカルアラインメント発見
dep: dascrubber

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
dep: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data
dep: libc6 (>= 2.27)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libfmt7 (>= 7.1.3+ds1)

fast type-safe C++ formatting library -- library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
dep: python3-colormap

ease manipulation of matplotlib colormaps and color codecs (Python 3)
dep: python3-matplotlib

Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
dep: python3-networkx

tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
dep: python3-numpy

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-pbcore

Python 3 library for processing PacBio data files
dep: python3-ujson

ultra fast JSON encoder and decoder for Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

圧縮ライブラリ - ランタイム

hinge のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	0.5.0-6+b2	431.8 kB	2,928.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.5.0-6+b2	392.1 kB	2,764.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.5.0-6+b2	372.4 kB	2,659.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.5.0-6+b2	377.8 kB	2,123.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.5.0-6+b2	431.7 kB	3,075.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.5.0-6+b2	378.9 kB	3,233.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	0.5.0-6+b2	383.5 kB	3,119.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.5.0-6+b2	420.3 kB	3,444.0 kB	[ファイル一覧]