パッケージ: dascrubber (1.1-2)

dascrubber に関するリンク

Debian の資源:

dascrubber ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [dazzlerblog.wordpress.com]

類似のパッケージ:

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

その他の dascrubber 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.7) [arm64, ppc64el 以外]

sug: daligner

ロングリードヌクレオチド配列間のローカルアラインメント発見
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

dascrubber のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	164.8 kB	1,185.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	142.4 kB	1,109.0 kB	[ファイル一覧]
armel	139.4 kB	1,139.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	137.6 kB	799.0 kB	[ファイル一覧]
i386	157.8 kB	1,327.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	135.9 kB	1,217.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	142.7 kB	1,279.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	165.9 kB	1,789.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	155.3 kB	1,237.0 kB	[ファイル一覧]