[ ソース: delly ]
パッケージ: delly (0.8.7-1)
Structural variant discovery by read analysis
Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.
その他の delly 関連パッケージ
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- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
delly のダウンロード
アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 317.4 kB | 1,030.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 279.0 kB | 938.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 251.9 kB | 864.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 263.5 kB | 616.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 337.7 kB | 1,068.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 299.2 kB | 1,255.0 kB | [ファイル一覧] |
mipsel | 299.5 kB | 1,213.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 320.3 kB | 1,238.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 288.1 kB | 1,074.0 kB | [ファイル一覧] |