Paquet : delly (0.8.7-1)

Liens pour delly

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source delly :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

découverte de variantes structurelles par analyse des lectures

Delly est une méthode de prédiction de variantes structurelles (SV) intégrée qui peut découvrir, génotyper et visualiser des délétions, des duplications en tandem, des inversions et des translocations à une résolution mononucléotidique dans des données de séquençage massivement parallèles à lecture courte et longue. Il utilise des extrémités appariées, des lectures fractionnées et une profondeur de lecture pour délimiter avec sensibilité et précision les réarrangements génomiques dans tout le génome.

Autres paquets associés à delly

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

bibliothèque Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

bibliothèque d'options de programmes pour C++
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 9)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger delly

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	317,4 ko	1 030,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	279,0 ko	938,0 ko	[liste des fichiers]
armel	251,9 ko	864,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	263,5 ko	616,0 ko	[liste des fichiers]
i386	337,7 ko	1 068,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	299,2 ko	1 255,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	299,5 ko	1 213,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	320,3 ko	1 238,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	288,1 ko	1 074,0 ko	[liste des fichiers]