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パッケージ: python3-pairtools-examples (0.3.0-2 など)

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類似のパッケージ:

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

その他の python3-pairtools-examples 関連パッケージ

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アーキテクチャ バージョン パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
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armel 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [ファイル一覧]
armhf 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [ファイル一覧]
i386 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [ファイル一覧]
s390x 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [ファイル一覧]