パッケージ: python3-pairtools (0.3.0-2 など)

python3-pairtools に関するリンク

Debian の資源:

pairtools ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

その他の python3-pairtools 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: cython3

C-Extensions for Python 3
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-nose

test discovery and running for Python3 unittest
dep: python3-numpy

Fast array facility to the Python 3 language

python3-pairtools のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	0.3.0-2+b2	121.3 kB	440.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.3.0-2+b2	110.5 kB	407.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.3.0-2+b2	109.3 kB	394.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.3.0-2+b2	109.4 kB	342.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.3.0-2+b2	119.7 kB	426.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.3.0-2+b2	108.1 kB	437.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	0.3.0-2+b2	108.0 kB	414.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.3.0-2+b2	120.3 kB	479.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.3.0-2+b2	107.5 kB	415.0 kB	[ファイル一覧]