パッケージ: autodock (4.2.6-8)

autodock に関するリンク

Debian の資源:

autodocksuite ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [autodock.scripps.edu]

類似のパッケージ:

タンパク質構造に結合するリガンドの分析ツール

AutoDock は、かなり小さいリガンド化学物質がかなり大きな受容体タンパク質へのドッキングする様子のシミュレーションを処理するプログラム群の代表パッケージです。以前のバージョンでは、配位子はすべての柔軟性を持っているのに対して、タンパク質は比較的剛直でした。この最新バージョン 4 は、表面残基の側鎖を選択して柔軟性を持たせることができます。すなわち、回転異性体を考慮に入れることができます。

AutoDock プログラムは、ターゲットタンパク質を記述するグリッド・セットへのリガンドの結合を処理します。このグリッドは AutoGrid により事前に計算されます。

タグ: 分野: 生物学, 構造生物学, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::analysing, works-with-format::TODO, 取り扱い対象: 3D モデル, 追加のタグが必要

その他の autodock 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armel, armhf, ppc64el 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

sug: autodocktools

パッケージは利用できません
sug: autogrid

リガンドの受容体への結合を事前計算

autodock のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	162.9 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	151.1 kB	375.0 kB	[ファイル一覧]
armel	157.3 kB	407.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	152.2 kB	315.0 kB	[ファイル一覧]
i386	161.4 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	165.2 kB	460.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	170.5 kB	454.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	162.9 kB	435.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	149.3 kB	399.0 kB	[ファイル一覧]