Paket: autodock (4.2.6-8)

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Externe Ressourcen:

Homepage [autodock.scripps.edu]

Analyse der Ligandenbindung von Proteinstrukturen

AutoDock ist ein erstklassiger Vertreter von Programmen zur Simulation einer Bindung relativ kleiner Liganden an verhältnismäßig große Rezeptor-Proteine. In vorhergehenden Versionen waren die Liganden sehr flexibel, während das Protein dagegen sehr starr behandelt wurde. Die aktuelle Version 4 erweitert die Flexibilität auf ausgewählte Seitenketten an der Oberfläche des Proteins, berücksichtigt also auch Rotamere.

AutoDock vollzieht die Bindung des Liganden an einer Auswahl von Gittern, die das Zielprotein beschreiben. AutoGrid berechnet diese Gitter vorab.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::analysing, works-with-format::TODO, Arbeitet mit: 3D-Modell, Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu autodock

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nicht armel, armhf, ppc64el]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

sug: autodocktools

Paket nicht verfügbar
sug: autogrid

Vorberechnung der Bindung von Liganden an ihren Rezeptor

autodock herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	162,9 kB	411,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	151,1 kB	375,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	157,3 kB	407,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	152,2 kB	315,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	161,4 kB	411,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	165,2 kB	460,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	170,5 kB	454,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	162,9 kB	435,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	149,3 kB	399,0 kB	[Liste der Dateien]