[ Source: srst2 ]
Package: srst2 (0.2.0-12)
Links for srst2
Debian Resources:
Download Source Package srst2:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [katholt.github.io]
Similar packages:
tipizzazione di sequenze di letture corte per batteri patogeni
Questo programma è progettato per prendere dati di sequenziamento Illumina, un database MLST e/o un database di sequenze geniche (es. geni di resistenza, geni di virulenza, ecc.) e riporta la presenza di ST o di geni di riferimento.
Other Packages Related to srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- allineatore di letture brevi ultraveloce ed efficiente
-
- dep: cd-hit
- suite di programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- libreria Python 3 per bioinformatica
-
- dep: python3-scipy
- strumenti scientifici per Python 3
-
- dep: samtools
- elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM
-
- rec: python3-rpy2
- interfaccia Python3 al linguaggio ed all'ambiente GNU R (versione 2)
Download srst2
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 59.8 kB | 265.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 59.8 kB | 265.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 59.8 kB | 265.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 59.8 kB | 265.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 59.8 kB | 265.0 kB | [list of files] |