Package: python3-freecontact (1.1-8 and others)
Links for python3-freecontact
Debian Resources:
Download Source Package python-freecontact:
- [python-freecontact_1.1-8.dsc]
- [python-freecontact_1.1.orig.tar.gz]
- [python-freecontact_1.1-8.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Laszlo Kajan (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
veloce predizione di contatto di proteine - collegamento per Python 3
FreeContact è uno strumento ottimizzato per la velocità per predire il contatto dei residui di proteine. Il suo input è un allineamento di sequenze multiple. FreeContact può funzionare come sostituto accelerato degli strumenti di predizione di contatti EVfold-mfDCA di DS. Marks (2011) e PSICOV di D. Jones (2011).
FreeContact è accelerato da una combinazione di istruzioni vettoriali, thread multipli e implementazione più veloce di parti chiave. A seconda dell'allineamento, sono possibili velocizzazioni di 8 volte o più.
È necessario un allineamento sufficientemente ampio per risultati significativi. Come minimo, dovrebbe essere usato un allineamento con un conteggio effettivo (dopo pesatura) di sequenze maggiore della lunghezza della sequenza di interrogazione. Allineamenti con decine di migliaia di sequenze (effettive) sono considerati un buon input.
Per esempio, jackhmmer(1) dal pacchetto hmmer o hhblits(1) da hhsuite possono essere usati per generare gli allineamenti.
Questo pacchetto contiene il collegamento per Python 3.
Other Packages Related to python3-freecontact
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- dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0)
- libreria Boost.Python
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- dep: libboost-python1.83.0-py312
- virtual package provided by libboost-python1.83.0
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- dep: libc6 (>= 2.32)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libfreecontact0t64 (>= 1.0.21)
- libreria per veloce predizione di contatto di proteine
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: python3 (<< 3.14)
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (>= 3.12~)
Download python3-freecontact
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| riscv64 | 1.1-8+b1 | 74.8 kB | 350.0 kB | [list of files] |