[ Source: murasaki ]
Package: murasaki (1.68.6-13 and others)
Links for murasaki
Debian Resources:
Download Source Package murasaki:
- [murasaki_1.68.6-13.dsc]
- [murasaki_1.68.6.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6.orig.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6-13.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
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Murasaki è uno strumento per la rilevazione di omologie in più genomi vasti veloce e basato sulla teoria del linguaggio. Permette allineamenti globali multipli di genomi su scala di intero genoma. Gestisce modelli di lunghezza illimitata con gap e seed e filtraggio unico basato su TF-IDF.
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* estremamente veloce (17 ore di CPU per l'intero genoma uomo x topo (con 40 nodi: 52 minuti di orologio)) * scalabile (parallelizzabile a piacimento tra più nodi usando MPI. Anche un singolo nodo con 16 GB di RAM può gestire più di 1 Gpb di sequenza.) * con lunghezza illimitata dei modelli * tollerante alle ripetizioni * con riduzione intelligente del rumore
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- strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti (file comuni)
Download murasaki
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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riscv64 | 1.68.6-13+b3 | 572.8 kB | 3,211.0 kB | [list of files] |