Package: libjellyfish-2.0-dev (2.3.1-3 and others)
Links for libjellyfish-2.0-dev
Debian Resources:
Download Source Package jellyfish:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Shaun Jackman (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.genome.umd.edu]
Similar packages:
conta i k-meri in sequenze di DNA (file di sviluppo di jellyfish)
JELLYFISH è uno strumento per contare in modo veloce ed efficiente in termini di memoria i k-meri nel DNA. Un k-mero è una sottostringa di lunghezza k, e contare le occorrenze di tutte queste sottostringhe è un passo fondamentale in molte analisi delle sequenze del DNA. JELLYFISH può contare i k-meri usando una quantità di memoria un ordine di grandezza più piccola e una velocità di un ordine di grandezza più grande di quelle degli altri pacchetti per il conteggio dei k-meri, grazie all'uso di una codifica efficiente di una tabella hash e sfruttando l'istruzione "compare-and-swap" della CPU per aumentare il parallelismo.
JELLYFISH è un programma a riga di comando che legge file FASTA e multi-FASTA contenenti sequenze di DNA. Produce in output il suo conteggio dei k-meri in formato binario, che può essere tradotto in testo intelligibile usando il comando "jellyfish dump".
Questo pacchetto contiene i file di sviluppo (libreria statica e file header).
Other Packages Related to libjellyfish-2.0-dev
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- dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.1-3+b6)
- conta i k-meri in sequenze di DNA (libreria dinamica di jellyfish)
Download libjellyfish-2.0-dev
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| riscv64 | 2.3.1-3+b6 | 268.8 kB | 2,294.0 kB | [list of files] |