Package: bedtools (2.31.1+dfsg-2)

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suite di utilità per confrontare tratti genomici

Le utilità BEDTools permettono di affrontare compiti comuni negli studi genomici, come trovare i tratti che si sovrappongono e calcolare la copertura. Le utilità sono largamente basate su quattro formati di file di largo uso: BED, GFF/GTF, VCF e SAM/BAM. Usando BEDTools si possono sviluppare pipe sofisticate che rispondono a domande di ricerca complesse mediante l'uso di svariati BEDTools in un flusso comune.

L'utilità groupBy è distribuita nel pacchetto filo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

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dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

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libreria per compressione in formato XZ
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

libreria GNU Standard C++, versione 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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