Package: bandage (0.9.0-2 and others)
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Download Source Package bandage:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rrwick.github.io]
Similar packages:
applicazione bioinformatica per navigare facilmente grafi di assemblati de novo
Bandage è un programma con GUI che permette agli utenti di interagire con grafi di assemblati creati da assemblatori de novo come Velvet, SPAdes, MEGAHIT e altri.
I grafi degli assemblati de novo non contengono solo i contig assemblati, ma anche le connessioni tra tali contig, che precedentemente non erano facilmente accessibili. Bandage visualizza grafi di assemblati, con connessioni, usando algoritmi di disposizione di grafi. I nodi nel grafo disegnato, che rappresentano i contig, possono essere automaticamente etichettati con il loro ID, lunghezza o profondità. Gli utenti possono interagire con il grafo spostando, etichettando e colorando i nodi. Le informazioni sulla sequenza possono essere estratte anche direttamente dal visualizzatore del grafo. Visualizzando le connessioni tra contig, Bandage apre nuove possibilità per analizzare e migliorare gli assemblati de novo, che non sono possibili osservando i contig da soli.
Ulteriori informazioni e collegamenti per il download si trovano sul sito web di Bandage: rrwick.github.io/Bandage
Il pacchetto è attinente al campo dell'assemblaggio del genoma.
Other Packages Related to bandage
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.0)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1)
- modulo principale di Qt 5
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- dep: libqt5gui5t64 (>= 5.8.0)
- modulo GUI di Qt 5
- or libqt5gui5-gles (>= 5.8.0)
- modulo GUI di Qt 5 — variante OpenGL ES
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- dep: libqt5svg5 (>= 5.6.0~beta)
- modulo SVG di Qt 5
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- dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.15.1)
- modulo per widgets di Qt 5
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
Download bandage
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.9.0-2+b1 | 964.0 kB | 2,328.0 kB | [list of files] |