simulatore per letture di sequenziamento PacBio
I sequenziatori di DNA PacBio producono due tipi di letture
caratteristiche: CCS (corte e con basso tasso d'errore) e CLR (lunghe e con
alto tasso d'errore), che possono essere entrambe utili per l'assemblaggio
de novo di genomi. PBSIM simula tali letture PacBio da una sequenza di
riferimento usando una simulazione basata su modello o su campionamento. Le
letture simulate sono utili, ad esempio, quando si sviluppano o valutano
assemblatori di sequenza pensati per dati PacBio.
