Package: tandem-mass (1:201702011-1 and others)
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Debian Resources:
Download Source Package tandem-mass:
- [tandem-mass_201702011-1.dsc]
- [tandem-mass_201702011.orig.tar.gz]
- [tandem-mass_201702011-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.thegpm.org]
Similar packages:
software per spettrometria di massa per identificare proteine
X! Tandem può trovare la corrispondenza tra spettri di massa tandem e sequenze peptidiche, in un processo che viene comunemente usato per effettuare l'identificazione delle proteine.
Questo software ha una API (interfaccia per programmazione di applicazioni) molto semplice e non sofisticata: accetta semplicemente nella riga di comando un file XML con le istruzioni e produce in output i risultati in un file XML che è stato specificato nel file XML di input. Il formato del file di output è descritto all'indirizzo http://www.thegpm.org/docs/X_series_output_form.pdf.
A differenza di alcuni motori di ricerca delle generazioni precedenti, tutta la serie X! dei motori di ricerca calcola l'intervallo statistico di confidenza (valori attesi) per tutte le singole assegnazioni spettro-sequenza. Riassemblano anche tutti le assegnazioni dei peptidi in un insieme di dati nelle sequenze proteiche conosciute e assegnano la confidenza statistica che questo assemblaggio e allineamento non siano casuali. È possibile trovare la formula all'interno; perciò non è necessario utilizzare un software separato per l'assemblaggio e l'analisi statistica, come ad esempio PeptideProphet e ProteinProphet.
Other Packages Related to tandem-mass
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- dep: libc6 (>= 2.27) [not alpha, ia64, riscv64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha, ia64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
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- dep: libexpat1 (>= 2.0.1)
- libreria C per l'analisi di file XML - libreria runtime
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- Package not available
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [alpha, sh4, sparc64]
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Package not available
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- dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Package not available
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [not riscv64]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
Download tandem-mass
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 1:201702011-1 | 216.6 kB | 745.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 1:201702011-1+b1 | 220.0 kB | 641.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1:201702011-1 | 191.3 kB | 564.0 kB | [list of files] |
| armel | 1:201702011-1 | 182.0 kB | 539.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1:201702011-1 | 187.8 kB | 387.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 1:201702011-1 | 226.4 kB | 642.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1:201702011-1 | 235.7 kB | 679.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 1:201702011-1 | 290.8 kB | 1,314.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 1:201702011-1 | 180.9 kB | 574.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1:201702011-1 | 203.9 kB | 790.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 1:201702011-1 | 221.1 kB | 794.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1:201702011-1 | 228.1 kB | 792.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1:201702011-1+b1 | 198.7 kB | 460.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1:201702011-1 | 187.3 kB | 636.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 1:201702011-1 | 240.0 kB | 550.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 1:201702011-1 | 181.0 kB | 604.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 1:201702011-1 | 207.9 kB | 583.0 kB | [list of files] |