[ Source: qcat ]
Package: qcat-examples (1.1.0-6)
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demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ (esempi)
Qcat รจ uno strumento a riga di comando per fare il demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ. Accetta file FASTQ con basi identificate e divide le letture in file FASTQ separati secondo il loro codice a barre. Qcat rende gli algoritmi di demultiplexing usati in albacore/guppy e EPI2ME disponibili per essere usati localmente con file FASTQ. Attualmente qcat implementa l'algoritmo EPI2ME.
Questo pacchetto contiene esempi per testare qcat.
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