Package: python3-presto (0.7.2-1)
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Similar packages:
toolkit per elaborare sequenze di cellule B e T (modulo Python 3)
pRESTO è un toolkit per elaborare letture grezze da sequenziamento ad alte prestazioni di repertori di cellule B e cellule T.
Gli enormi miglioramenti nelle tecnologie di sequenziamento ad alte prestazioni permettono ora la caratterizzazione su larga scala di repertori di linfociti, definiti come raccolte di proteine antigene-recettore trans-membrana posizionate sulla superficie di cellule B e cellule T. pRESTO (REpertoire Sequencing TOolkit) è composto da una suite di utilità per gestire tutti gli stadi dell'elaborazione di sequenze prima dell'assegnazione di segmenti a linee germinali. pRESTO è progettato per gestire letture singole o a terminali accoppiati. Include funzionalità per controllo di qualità, mascheramento dei primer, annotazione delle letture con codici a barre incorporati nelle sequenze, generazione di sequenze di consenso UMI (Unique Molecular Identifier), assemblaggio di letture a terminali accoppiati e identificazione di sequenze duplicate. Sono incluse anche numerose opzioni per operazioni di ordinamento, campionamento e conversione delle sequenze.
Questo pacchetto fornisce il modulo Python 3 di presto.
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Download python3-presto
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| armel | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| armhf | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| i386 | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 44.5 kB | 219.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| s390x | 77.7 kB | 513.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 44.5 kB | 219.0 kB | [list of files] |