[ Source: kmer ]
Package: meryl (0~20150903+r2013-9 and others)
Links for meryl
Debian Resources:
Download Source Package kmer:
- [kmer_0~20150903+r2013-9.dsc]
- [kmer_0~20150903+r2013.orig.tar.gz]
- [kmer_0~20150903+r2013-9.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [kmer.sourceforge.net]
Similar packages:
conteggio di k-meri in- e out-of-core e utilità
meryl calcola il contenuto di k-meri di sequenze genomiche. Il contenuto di k-meri è rappresentato come una lista di k-meri e il numero di volte che ognuno di essi appare nelle sequenze di input. Il k-mero può essere ristretto solamente al k-mero forward, solo a quello reverse o al k-mero canonico (lessicograficamente più piccolo del k-mero forward e reverse ad ogni posizione). Meryl può riportare l'istogramma dei conteggi, la lista dei k-meri e il loro conteggio o può effettuare operazioni matematiche o insiemistiche sui file dei dati elaborati.
Questo pacchetto fa parte della suite Kmer.
Other Packages Related to meryl
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- dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [not ia64]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 5) [ia64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
-
- sug: gridengine-client
- utilità per la gestione di code di Grid Engine
Download meryl
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 0~20150903+r2013-9 | 209.0 kB | 1,705.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 0~20150903+r2013-9 | 194.5 kB | 1,457.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 0~20150903+r2013-9 | 188.6 kB | 1,571.0 kB | [list of files] |
| armel | 0~20150903+r2013-9 | 200.8 kB | 1,482.0 kB | [list of files] |
| armhf | 0~20150903+r2013-9 | 200.5 kB | 1,250.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 0~20150903+r2013-9 | 281.9 kB | 2,021.0 kB | [list of files] |
| i386 | 0~20150903+r2013-9 | 233.3 kB | 1,834.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 0~20150903+r2013-8+b3 | 268.4 kB | 2,565.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 0~20150903+r2013-9 | 243.7 kB | 1,938.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 0~20150903+r2013-9 | 209.5 kB | 1,820.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 0~20150903+r2013-9 | 202.9 kB | 1,833.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 0~20150903+r2013-9 | 209.5 kB | 1,764.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 0~20150903+r2013-9 | 213.1 kB | 1,285.0 kB | [list of files] |
| s390x | 0~20150903+r2013-9 | 178.3 kB | 1,482.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 0~20150903+r2013-9 | 280.5 kB | 1,890.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 0~20150903+r2013-9 | 179.3 kB | 7,479.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 0~20150903+r2013-9 | 198.9 kB | 1,454.0 kB | [list of files] |