Package: hyphy-mpi (2.5.62+dfsg-1 and others)

Links for hyphy-mpi

Debian Resources:

Download Source Package hyphy:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Andreas Tille (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)
Nilesh Patra (QA Page)

External Resources:

Homepage [hyphy.org]

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test di ipotesi usando filogenesi (versione MPI)

HyPhy è un pacchetto software open source per l'analisi di sequenze genetiche usando tecniche di filogenetica, evoluzione molecolare e apprendimento macchina. Ha un'interfaccia utente grafica (GUI) completa e un ricco linguaggio per script per una illimitata personalizzazione delle analisi. In aggiunta HyPhy gestisce ambienti di calcolo parallelo (attraverso interfaccia di passaggio di messaggi) e può essere compilato come libreria condivisa e richiamato da altri ambienti di programmazione, come Python o R. Il proseguimento dello sviluppo di HyPhy è attualmente supportato in parte da un premio NIGMS R01 1R01GM093939.

Questo pacchetto fornisce un eseguibile che utilizza MPI per fare la multielaborazione.

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dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

libreria di supporto a GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

libreria di supporto a GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

libreria di supporto a GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

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dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

libreria condivisa SQLite 3
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

toolkit Secure Sockets Layer - librerie condivise
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

libreria GNU Standard C++, versione 3
dep: libunwind8 [ia64]

libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

libreria di compressione - runtime

Download hyphy-mpi

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.5.60+dfsg-1	838.6 kB	2,917.0 kB	[list of files]
amd64	2.5.62+dfsg-1	1,501.7 kB	7,526.0 kB	[list of files]
arm64	2.5.62+dfsg-1	798.8 kB	2,336.0 kB	[list of files]
armel	2.5.62+dfsg-1	773.7 kB	2,171.0 kB	[list of files]
armhf	2.5.62+dfsg-1	762.1 kB	1,491.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.5.62+dfsg-1	814.7 kB	2,402.0 kB	[list of files]
i386	2.5.62+dfsg-1	1,019.1 kB	2,671.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.5.60+dfsg-1	1,061.2 kB	4,867.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.5.62+dfsg-1	768.6 kB	2,407.0 kB	[list of files]
mips64el	2.5.62+dfsg-1	790.2 kB	3,491.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.5.62+dfsg-1	898.0 kB	3,040.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.5.62+dfsg-1	917.3 kB	2,848.0 kB	[list of files]
riscv64	2.5.62+dfsg-1	892.2 kB	1,868.0 kB	[list of files]
s390x	2.5.62+dfsg-1	954.6 kB	2,684.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.5.62+dfsg-1	927.0 kB	2,080.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.5.62+dfsg-1	715.2 kB	3,114.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.5.62+dfsg-1	930.9 kB	2,343.0 kB	[list of files]