risorse opzionali per il pacchetto mmseqs2
MMseqs2 (ricerca di sequenze Many-against-Many, molti-contro-molti) è una
suite software per cercare e fare cluster di enormi insiemi di sequenze
proteiche/nucleotidiche. MMseqs2 è software open source con licenza GPL
implementato in C++ per Linux, MacOS e (come versione beta attraverso
cygwin) Windows. Il software è progettato per essere eseguito su core e
server multipli e dimostra una scalabilità molto buona. L'esecuzione di
MMseqs2 può essere 10.000 volte più veloce di BLAST. A 100 volte la sua
velocità ottiene quasi la stessa sensibilità. Può effettuare ricerche di
profili con la stessa sensibilità di PSI-BLAST a una velocità più di 400
volte superiore.