Package: khmer (3.0.0~a3+dfsg-9~0exp and others)

Links for khmer

Debian Resources:

Download Source Package khmer:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [khmer.readthedocs.org]

Similar packages:

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

attraversamento grafi, filtri e conteggi in memoria di k-meri in sequenze di DNA

khmer è una libreria e una suite di strumenti a riga di comando per lavorare con sequenze di DNA. È principalmente mirata ai dati di sequenziamento con letture corte, come quelli prodotti dalla piattaforma Illumina. khmer ha un approccio alla analisi di sequenze centrato sui k-meri, e da questo deriva il suo nome.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Comparing, Filtering

Other Packages Related to khmer

depends

recommends

suggests

enhances

dep: khmer-common

file comuni per gli strumenti del progetto khmer
dep: libbz2-1.0

libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
dep: libc6 (>= 2.38)

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

libreria di supporto a GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

libreria GNU Standard C++, versione 3
dep: python3

linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

dep: python3 (<< 3.13)

dep: python3 (>= 3.12~)
dep: python3-screed

utilità per sequenze di letture di nucleotidi corte in Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

libreria di compressione - runtime

Download khmer

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3.0.0~a3+dfsg-9~0exp+b1	7,061.4 kB	40,948.0 kB	[list of files]