Package: sigma-align (1.1.3-6)

semplici allineamenti multipli "greedy" di sequenze di DNA non codificante

Sigma ("Simple greedy multiple alignment") è un programma per allineamenti. Il suo algoritmo e lo schema dei punteggi sono progettati specificatamente per le sequenze non codificanti di DNA.

Usa una strategia di ricerca del miglior allineamento locale possibile senza gap. Questo succede ad ogni passo creando il miglior allineamento possibile che sia coerente con gli allineamenti esistenti. Assegna un punteggio alla significatività dell'allineamento in base alla lunghezza dei frammenti allineati e ad un modello di fondo. Questi possono essere forniti o stimati da un file ausiliario di DNA intergenico.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

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