Package: nanopolish (0.11.0-2)
Links for nanopolish
Debian Resources:
Download Source Package nanopolish:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
identificatore di sequenze di consenso per dati di sequenziamento a nanopori
Nanopolish usa un modello di Markov nascosto segnale-livello per l'identificazione di sequenze di consenso di dati di sequenziamento a nanopori di genomi. Può eseguire l'analisi a livello di segnale di dati di sequenziamento Oxford Nanopore. Nanopolish può calcolare una sequenza di consenso migliorata per una bozza di assemblaggio genomico, rilevare modificazioni di basi, identificare SNP e indel in rapporto ad un genoma di riferimento e altro ancora.
Other Packages Related to nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.27)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1)
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
-
- dep: libhdf5-103
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - file runtime - versione seriale
-
- dep: libhts2 (>= 1.4.1)
- libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
-
- dep: python
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
-
- rec: python-biopython
- libreria Python per bioinformatica (implementata in Python 2)
-
- rec: python-pysam
- interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 2)
Download nanopolish
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 2,162.9 kB | 9,781.0 kB | [list of files] |