[ Source: murasaki ]
Package: murasaki (1.68.6-8 and others)
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Maintainers:
External Resources:
- Homepage [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
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strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti
Murasaki è uno strumento per la rilevazione di omologie in più genomi vasti veloce e basato sulla teoria del linguaggio. Permette allineamenti globali multipli di genomi su scala di intero genoma. Gestisce modelli di lunghezza illimitata con gap e seed e filtraggio unico basato su TF-IDF.
Murasaki è un software per allineamento ad ancore, che è
* estremamente veloce (17 ore di CPU per l'intero genoma uomo x topo (con 40 nodi: 52 minuti di orologio)) * scalabile (parallelizzabile a piacimento tra più nodi usando MPI. Anche un singolo nodo con 16 GB di RAM può gestire più di 1 Gpb di sequenza.) * con lunghezza illimitata dei modelli * tollerante alle ripetizioni * con riduzione intelligente del rumore
Other Packages Related to murasaki
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- dep: libboost-filesystem1.67.0
- operazioni su filesystem (percorsi portabili, iterazione su directory, ecc.) in C++
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- dep: libboost-iostreams1.67.0
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also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
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- dep: murasaki-common
- strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti (file comuni)
Download murasaki
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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amd64 | 1.68.6-8+b1 | 499.2 kB | 3,215.0 kB | [list of files] |
arm64 | 1.68.6-8+b1 | 443.2 kB | 3,063.0 kB | [list of files] |
armhf | 1.68.6-8+b1 | 381.3 kB | 1,953.0 kB | [list of files] |
i386 | 1.68.6-8+b1 | 512.8 kB | 3,197.0 kB | [list of files] |