[ Source: roary ]
Package: roary (3.12.0+dfsg-2)
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- Homepage [sanger-pathogens.github.io]
Similar packages:
catena di strumenti autonoma ad alta velocità per pan-genomi
Roary è una catena di strumenti autonoma ad alta velocità per pan-genomi, che accetta assemblati annotati in formato GFF3 (come prodotti, ad esempio, da Prokka) e calcola il pan-genoma. Utilizzando un PC desktop standard può analizzare insiemi di dati con migliaia di campioni, cosa che è impossibile, dal punto di vista del calcolo, con i metodi esistenti senza compromettere la qualità dei risultati. 128 campioni possono essere analizzati in meno di 1 ora, usando 1 GB di RAM e un processore singolo. Per effettuare questa analisi utilizzando metodi esistenti servirebbero settimane e centinaia di GB di RAM. Roary non è pensato per la meta-genomica o per confrontare insiemi estremamente diversi di genomi.
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Download roary
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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| all | 171.7 kB | 659.0 kB | [list of files] |