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identificazione del genotipo, determinazione della fase di genotipo e imputazione di marcatori non genotipizzati

Beagle fa identificazione del genotipo, determinazione della fase di genotipo, imputazione di marcatori non genotipizzati e rilevamento di segmenti di identità per discendenza. L'imputazione genotipica funziona su aplotipi a fase usando il modello di frequenza di aplotipi di Li e Stephens. Beagle implementa anche l'algoritmo Refined IBD per rilevazione di segmenti di omozigosità per discendenza (HBD) e identità per discendenza (IBD).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::java, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

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