[ Source: qcat ]
Package: qcat (1.1.0-2)
Links for qcat
Debian Resources:
Download Source Package qcat:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ
Qcat è uno strumento a riga di comando per fare il demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ. Accetta file FASTQ con basi identificate e divide le letture in file FASTQ separati secondo il loro codice a barre. Qcat rende gli algoritmi di demultiplexing usati in albacore/guppy e EPI2ME disponibili per essere usati localmente con file FASTQ. Attualmente qcat implementa l'algoritmo EPI2ME.
Other Packages Related to qcat
|
|
|
|
-
- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
-
- dep: python3-biopython
- libreria Python 3 per bioinformatica
-
- dep: python3-parasail (>= 1.2-3)
- Python3 bindings for the parasail C library
-
- dep: python3-six
- libreria di compatibilità per Python 2 e 3 (interfaccia Python 3)
-
- dep: python3-yaml
- analizzatore ed emettitore YAML per Python 3
-
- sug: qcat-examples
- demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ (esempi)
Download qcat
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 30.3 kB | 269.0 kB | [list of files] |