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Package: python3-pairtools (0.3.0-2 and others)

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infrastruttura per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C

Semplice e veloce infrastruttura a riga di comando per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C.

Elabora allineamenti di sequenze a terminali appaiati ed effettua le seguenti operazioni:

 - rileva giunzioni di legatura (alias coppie Hi-C) in sequenze allineate,
   a terminali accoppiati, di molecole di DNA Hi-C;
 - ordina file .pairs per analisi successive;
 - rileva, applica tag e rimuove duplicati di PCR/ottici;
 - genera statistiche esaurienti su insiemi di dati Hi-C;
 - seleziona coppie Hi-C in base a criteri definiti in modo flessibile;
 - ripristina allineamenti .sam da coppie Hi-C.

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Architecture Version Package Size Installed Size Files
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armel 0.3.0-2+b2 109.3 kB394.0 kB [list of files]
armhf 0.3.0-2+b2 109.4 kB342.0 kB [list of files]
i386 0.3.0-2+b2 119.7 kB426.0 kB [list of files]
mips64el 0.3.0-2+b2 108.1 kB437.0 kB [list of files]
mipsel 0.3.0-2+b2 108.0 kB414.0 kB [list of files]
ppc64el 0.3.0-2+b2 120.3 kB479.0 kB [list of files]
s390x 0.3.0-2+b2 107.5 kB415.0 kB [list of files]