Package: nanolyse (1.2.0-1)
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Similar packages:
rimuove le letture del fago lambda da un file fastq
NanoLyse è uno strumento per la rimozione rapida di DNA contaminante, che usa l'allineatore Minimap2 attraverso il collegamento Python mappy. Un'applicazione tipica è la rimozione del frammento di DNA di controllo del fago lambda fornito da ONT, per il quale è inclusa in questo pacchetto la sequenza di riferimento. Questo approccio, tuttavia, può portare a perdite non volute di letture da regioni altamente omologhe al genoma del fago lambda.
Other Packages Related to nanolyse
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- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
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- dep: python3-biopython
- libreria Python 3 per bioinformatica
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- dep: python3-mappy
- interfaccia Python 3 per minimap2
Download nanolyse
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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ppc64el | 24.5 kB | 66.0 kB | [list of files] |