Package: clustalx (2.1+lgpl-9)

allineamento multiplo di sequenze di acidi nucleici e di proteine (interfaccia grafica)

Questo pacchetto offre un'interfaccia grafica per il programma di allineamento di sequenze multiple Clustal. Fornisce un ambiente integrato per effettuare allineamenti di sequenze e profili multipli per analizzare i risultati. L'allineamento delle sequenze è visualizzato in una finestra sullo schermo. Uno schema di colorazione versatile è stato incorporato per evidenziare le caratteristiche conservate nell'allineamento. Per le presentazioni professionali occorre usare il pacchetto LaTeX texshade o boxshade.

Il menù a tendina in alto nella finestra permette di selezionare tutte le opzioni richieste per l'allineamento tradizionale di sequenze e profili multipli. Possono essere copiate ed incollate le sequenze per modificare l'ordine dell'allineamento; si può selezionare un sottoinsieme di sequenze che devono essere allineate; si può selezionare un sottointervallo dell'allineamento per essere riallineato e reinserito in quello originale.

Può essere fatta un'analisi qualitativa dell'allineamento e possono essere evidenziati i segmenti con basso punteggio o i residui eccezionali.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Purpose: Comparing, use::viewing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag, X Window System: Application

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