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Package: brig (0.95+dfsg-3)

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BLAST Ring Image Generator

BRIG può visualizzare confronti circolari tra grandi quantità di genomi, con un accento sulla gestione dei dati di assemblaggio dei genomi. 

 * Le immagini mostrano sotto forma di cerchi concentrici le similarità
   tra una sequenza centrale di riferimento e altre sequenze.
 * BRIG esegue automaticamente tutti i confronti BLAST e l'analisi dei
   file tramite una semplice GUI.
 * I confini dei contig e la copertura delle letture possono essere
   visualizzati per le bozze di genoma; possono essere visualizzati grafici
   personalizzati e annotazioni.
 * Usando come input un insieme di geni definito dall'utente, BRIG può
   visualizzare la presenza, l'assenza, il troncamento o la variazione
   della sequenza di un gene in un insieme di genomi completi, bozze di
   genoma e perfino dati di sequenza non assemblati, grezzi.
 * BRIG accetta anche file di mappa di letture in formato SAM permettendo
   di confrontare simultaneamente regioni genomiche presenti in sequenze
   non assemblate da campioni multipli.

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