[ Source: allelecount ]
Package: liballelecount-perl (4.2.1-1)
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Similar packages:
interfaccia Perl agli algoritmi per numeri di copie NGS
Codice di supporto per algoritmi per numeri di copie NGS. Prende un file di posizioni e un file [cr|b]am e genera un conteggio di copertura di ciascun allele [ACGT] in tale posizione (con qualsiasi impostazione di filtro).
Il pacchetto alleleCount esiste principalmente per evitare duplicazione di codice tra alcuni altri progetti, specificamente AscatNGS e Battenberg.
Questo pacchetto mette a disposizione l'interfaccia Perl a alleleCounter che fornisce Sanger::CGP::AlleleCount::Genotype.
Other Packages Related to liballelecount-perl
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- dep: libconst-fast-perl
- facility for creating read-only scalars, arrays, and hashes
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- dep: libdevel-cover-perl
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- dep: libfile-slurp-perl
- procedure per lettura e scrittura di file con una sola chiamata
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- dep: libfile-which-perl
- modulo Perl per cercare programmi eseguibili nel PATH
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- dep: libipc-system-simple-perl
- modulo Perl per eseguire comandi semplicemente, con diagnostica dettagliata
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- dep: libpod-coverage-perl
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- dep: libtest-fatal-perl (>= 0.013)
- modulo per testare codice con eccezioni
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- dep: libtry-tiny-perl
- modulo che fornisce un try/catch minimalistico
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- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
Download liballelecount-perl
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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| all | 20.5 kB | 70.0 kB | [list of files] |