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[ Source: plink1.9  ]

Package: plink1.9 (1.90~b6.21-201019-1)

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insieme di strumenti di analisi per associazione dell'intero genoma

plink si aspetta in input i dati da chip SNP (polimorfismi a singolo nucleotide) di molti individui e la loro descrizione fenotipica di una malattia. Trova associazioni tra una variazione singola o una coppia di variazioni nel DNA con un fenotipo e può recuperare le annotazioni SNP da una fonte in linea.

Gli SNP possono essere analizzati individualmente o a coppie per valutare la loro associazione con fenotipi di malattie. È possibile ricercare congiuntamente variazioni nel numero di copie. Sono stati implementati svariati test statistici.

plink1.9 è un esteso aggiornamento di plink con nuovi algoritmi e nuovi metodi, più veloce e con meno consumo di memoria rispetto al primo plink.

Notare che l'eseguibile è stato rinominato in plink1.9 per una collisione di nomi. Ulteriori informazioni su questo possono essere lette in /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

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