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Package: libhmsbeagle-java (3.1.2+dfsg-10)

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libreria ad alte prestazioni per filogenetica bayesiana e a massima verosimiglianza (Java)

BEAGLE è una libreria ad alte prestazioni che può effettuare i calcoli centrali al cuore della maggior parte dei pacchetti per filogenetica bayesiana e con massima verosimiglianza. Può utilizzare processori altamente paralleli, come quelli nelle schede grafiche (GPU) trovate in molti PC.

Il progetto include un'API aperta e implementazioni veloci di una libreria per valutare verosimiglianze filogenetiche (processi di Markov continui nel tempo) dell'evoluzione di sequenze biomolecolari.

Lo scopo è quello di fornire "servizi" di valutazione ad alte prestazioni ad un'ampia gamma di software filogenetico, sia campionatori bayesiani sia ottimizzatori a massima verosimiglianza. Ciò permette a questi pacchetti di utilizzare implementazioni che fanno uso di hardware ottimizzato, come le unità di elaborazione grafica.

Questo pacchetto contiene l'interfaccia Java.

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