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strumento per raggruppare in cluster milioni di corte sequenze di DNA

dnaclust è uno strumento per raggruppare in cluster un vasto numero di corte sequenze di DNA. I cluster vengono creati in un modo tale che il "raggio" di ogni cluster è più piccolo di una soglia specificata.

Le sequenze di input da raggruppare in cluster devono essere in formato Fasta. L'ID di ogni sequenza è basato sulla prima parola della sequenza nel formato Fasta. La prima parola è il prefisso dell'intestazione fino alla prima occorrenza di caratteri vuoti di spazio nell'intestazione.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C++, Role: role::program, works-with::biological-sequence

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armhf 3-7+b2 99.1 kB574.0 kB [list of files]
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mips64el 3-7+b2 110.5 kB748.0 kB [list of files]
mipsel 3-7+b2 110.0 kB723.0 kB [list of files]
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s390x 3-7+b2 105.8 kB689.0 kB [list of files]