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Package: saint (2.5.0+dfsg-4 and others)

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Significance Analysis of INTeractome - analisi di significato di interactomi

SAINT implementa l'algoritmo di punteggio per dati di interazioni proteina-proteina usando dati di proteomica quantitativa "label-free" in esperimenti AP-MS. È stato usato per dati di conteggi spettrali nel lavoro sull'interactoma lievito-chinasi non incorporando la purificazione del controllo, così come implementazione generalizzata per dati di conteggio spettrale con e senza purificazione del controllo.

In alternativa, si può anche eseguire SAINT insieme a ProHits.

Il pacchetto è stato scritto per fare analisi con o senza IP di controllo.

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