[ Source: megadepth ]
Package: megadepth (1.2.0-4)
Links for megadepth
Debian Resources:
Download Source Package megadepth:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
calcola la copertura da file di sequenziamento BigWig e BAM
Una delle principali preoccupazioni nell'interpretazione di sequenziamenti di DNA e RNA (!) è il numero di letture che coprono una particolare area. Questo pacchetto ha statistiche interessanti per la distinzione tra parti codificanti e non codificanti del genoma e sa come interpretare trascritti che si estendono su più esoni.
Questo pacchetto è un successore del programma "bamcount".
Other Packages Related to megadepth
|
|
|
|
-
- dep: libbigwig0 (>= 0.4.6+dfsg)
- C library for handling bigWig files
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
-
- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
Download megadepth
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 78.3 kB | 266.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 68.9 kB | 274.0 kB | [list of files] |
| armel | 68.7 kB | 273.0 kB | [list of files] |
| armhf | 69.1 kB | 209.0 kB | [list of files] |
| i386 | 81.1 kB | 273.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 68.8 kB | 281.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 70.7 kB | 279.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 81.5 kB | 338.0 kB | [list of files] |
| s390x | 70.2 kB | 262.0 kB | [list of files] |