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rilevamento di sistemi macromolecolari in insiemi di dati di proteine

MacSyFinder è un programma per modellare e rilevare sistemi macromolecolari, percorsi genetici, ... in insiemi di dati di proteine. Nei procarioti, questi sistemi hanno spesso proprietà che si conservano nell'evoluzione: sono costituiti da componenti conservati e sono codificati in loci compatti (architettura genetica conservata). L'utente modella questi sistemi con MacSyFinder per rispecchiare queste proprietà conservate, e per permettere la loro rilevazione efficiente.

Questo pacchetto presenta l'API Java open source per i database biologici e una serie di algoritmi, la maggior parte basati su sequenze.

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