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Package: libgkarrays-dev (2.1.0+dfsg-4)

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libreria per interrogare grandi collezioni di sequenze NGS (sviluppo)

Gli Gk-array vengono forniti come libreria C++ facile da usare dedicata alle interrogazioni di grandi collezioni di sequenze, come quelle prodotte da sequenziatori ad alte prestazioni (es. HiSeq 2000 da Illumina, 454 da Roche).

Gli Gk-array indicizzano i k-meri delle letture e permettono di rispondere a diverse interrogazioni su quella collezione di letture (es. quante letture condividono questo k-mero? dove è presente questo k-mero nella collezione di letture?).

Gli Gk-array rappresentano un'alternativa efficiente alle tabelle hash in termini di spazio, pur essendo simili in termini di tempi di interrogazione.

Questa è la libreria di sviluppo per libgkarrays.

Tags: Software Development: Libraries, Role: Development Library

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