Package: dextractor (1.0-6)

libreria dextractor di comandi di estrazione e compressione

I comandi di dextractor permettono di recuperare esattamente e solamente le informazioni necessarie per assemblato e ricostruzione dai file sorgenti HDF5 prodotti dal sequenziatore PacBio RS II, o dai file sorgenti BAM prodotti dal sequenziatore PacBio Sequel.

Per ciascuno dei tre tipi di file estratti (fasta, quiva e arrow) la libreria contiene comandi per comprimere il tipo di file dato e per decomprimerlo, che è un processo reversibile che restituisce il file originale non compresso. I file .fasta compressi, con l'estensione .dexta, consumano 1/4 di byte per base. I file .quiva compressi, con l'estensione .dexqv, consumano 1,5 byte per base in media, e i file .arrow compressi, con l'estensione .dexar, consumano 1/4 di byte per base.

Per ulteriori informazioni, consultare la documentazione disponibile all'indirizzo <https://github.com/thegenemyers/DEXTRACTOR>.

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